Обелете и нарежете на ситно лука и моркова. Задушете ги в олиото като добавите 1 чаена лъжичка сол. Задушаването е около 4-5 минути.
Към задушените зеленчуци добавяте каймата и задушавате до полуготовност. Често разбърквате за да се раздроби добре каймата и да стане на гранули. Прибавяте червеният пипер, разбърквате и отмествате от котлона.
Белите картофите, измивате и режете на ситни кубчета. Смесвате ги със задушената кайма. Добавяте зелените подправки, прясно смлян черен пипер 1/2 чаена лъжичка още 1 равна чаена лъжичка сол, 2 супени лъжици брашно (което равномерно поръсвате и разбърквате) и накрая доматите (ситно нарязани или пасирани), водата и разбърквате отново.
Прехвърляте в тава и печете в предварително загрята фурна на 180 градуса около 35-40 минути.
Киселото мляко разбивате с яйцата, 2-те супени лъжици брашното и 1/2 чаена лъжичка сол. С тази смес заливате запечената мусака и връщате отново във фурната за 8-10 минути да се запече.